(一)油菜适时收获，及时干燥
油菜种子收获以在花薹上角果有70％～80％呈现黄色时为宜。太早嫩籽多，水分高，不易脱粒，内容欠充实，较难贮藏；太迟则角果容易爆裂，子粒散落，造成损失。脱粒后要及时干燥，晒干后须经摊晾冷却才可进仓，以防种子堆内部温度过高，发生干热现象(即油菜种子因闷热而引起脂肪分解，增加酸度，降低出油率)。
(二)清除油菜泥沙杂质
油菜种子入库前，应进行风选1次，以清除尘芥杂质及病菌之类，可增强贮藏期间的稳定性。此外对水分及发芽率进行1次检验，以掌握油菜种子在入库前的情况。
(三)严格控制油菜入库水分
油菜种子入库的安全水分标准不宜机械规定，应视当地气候特点和贮藏条件而有一定的灵活性。就大多数地区一般贮藏条件而言，油菜种子水分控制在9％～10％以内，可保证安全，但如果当地特别高温多湿以及仓库条件较差，最好能将水分控制在8％～9％以内。根据四川省经验，水分超过10％，经高温季节，就会发生不正常现象，开始结块；水分在12％以上就会形成团饼，出现霉变现象。
(四)低温贮藏油菜
贮藏期间除水分须加控制外，种温也是一个重要因素，必须按季节严加控制，在夏季一般不宜超过28―30℃，春秋季不宜超过13～15℃，冬季不宜超过6～8℃，种温与仓温相差如超过3～5℃就应采取措施，进行通风降温。
(五)油菜合理堆放
油菜种子散装的高度应随水分多少而增减，水分在7％～9％时，堆高可达1.5～2.0m；水分在9％～10％时，堆高只能1～1.5m；水分在10％～12％时，堆高只能1m左右；水分超过12％时，应进行晾晒后再进仓。散装的种子可将表面耙成波浪形或锅底形，使油菜种子与空气接触面加大，有利于堆内湿热的散发。
油菜种子如采用袋装贮藏法应尽可能堆成各种形式的通风桩，如工字形，井字形等。油菜种子水分在9％以下时，可堆高10包，9％～10％的可堆8～9包，10％～12％的可堆6～7包，12％以上的高度不宜超过5包。
(六)加强油菜管理勤检查
油菜种子进仓时即使水分低，杂质少，仓库条件合乎要求，在贮藏期间仍须遵守一定的严格检查制度，一般在4～10月份，对水分在9％～12％之间的油菜种子，应每天检查2次，水分在9％以下应每天检查1次。在11月至来年3月份之间，对水分为9％～12％的油菜种子应每天检查1次，水分在9％以下的，可隔天检查1次。
