细菌性肠炎病、烂鳃病、亦皮病是草鱼的三大主要病害。近几年部分地区还出现了病毒性出血病，在实际生产中，这几种病都是并发性疾病，因此在预防上要相应的采取综合防治的方法。
①彻底清塘，主养草鱼的池塘必须在放养前彻底清塘，消灭病原和敌害生物。最好用生石灰干撒清塘，每 667平方米用量了5公斤。
②鱼种消毒，鱼种放养前必须消毒，可用3%～4%的食盐水溶液浸洗鱼种15分钟，也可用10毫升/公斤的漂白粉;8毫克/公斤的硫酸铜等其他消毒方法。
③饲料消毒，青饲料最好用5～10毫升/公斤的漂白粉溶液消毒后再投喂。
④食场消毒，6～9月份，每半个月对食场进行1次消毒，方法是在鱼吃食后用500克漂白粉溶水后泼洒在食场周围，也可采用挂袋或挂篓的方法消毒。
⑤限制食欲，草鱼贪吃.只要环境，适宜，食欲基本无节制，在高温。季节特别要限制草鱼的吃食量，一般喂到八成饱即可，更不能让草鱼吃夜草，每天坚持将剩余的残料捞出。
⑥池水消毒、投喂药饵，5～9月份，每半月池水清毒一次。常用药物及其用量：漂白粉1毫克/公斤，硫酸铜、硫酸亚铁合剂0.70毫克/公斤，敌百虫0.50毫克/公斤，生石灰20毫克/公斤，以上各类药物交替使用，效果较好。药饵投喂可每半月一次，每次3天，每100公斤饲料中加土霉素100克，或选用磺胺类、呋喃类等药物做成药饵，酌情投喂。
